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Twist Bioscience 推出 FlexPrep? 超高通量文庫制備試劑盒,適用于農(nóng)業(yè)基因組學和群體基因組學應用
來源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時間: 2024-11-13 | 577 次瀏覽 | 分享到:

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Twist Bioscience公司推出的FlexPrep? 超高通量文庫制備試劑盒,通過引入新穎的 Normalization by Ligation ? (NBL) 技術,改進標準酶促片段化文庫制備方法,以低成本實現(xiàn)高通量,旨在加速芯片用戶在群體基因組學和農(nóng)業(yè)基因組學領域的NGS研究。

Twist FlexPrep? 超高通量(UHT)文庫制備試劑盒

Twist FlexPrep ? 超高通量(UHT)文庫制備試劑盒的工作流程旨在為簡化和大規(guī)模擴展 Twist 已建立的酶切方法而設計。Normalization by Ligation ? (NBL) 技術消除了在文庫制備前對每個DNA樣本進行定量和對大量人工耗費的需要,從而大大節(jié)省了每個樣本的成本。在多孔板中對每個樣本進行片段化和接頭連接后,*多可以將12個樣本合并到一個管中,顯著減少后續(xù)磁珠純化和擴增步驟所需的試劑用量和成本??衫么嗽噭┖兄苽涞奈膸欤褂冒邢蚋患M合進行全基因組或靶向測序。所有多孔板和管式都經(jīng)過優(yōu)化,以確保與關鍵自動化系統(tǒng)兼容,這對于希望簡化工作流程并減少動手時間的實驗室來說是一個關鍵考慮因素。

關鍵優(yōu)勢

集成的NBL技術

? 消除前期歸一化處理

? 無需中間定量

? 樣品起始量區(qū)間寬泛(30ng-300ng)

早期混樣節(jié)省成本

? 接頭連接反應之后將96個樣本合并到8管中

? 降低上游反應體積

? 減少下游反應耗材

專為超高容量多重測序而生

? 單個試劑盒多達1152個UDIs

? 反應數(shù)量擴大12倍

? 每個靶向富集反應可支持96個樣本

數(shù)據(jù)展示

消除前期歸一化和中間定量樣品

Twist FlexPrep UHT文庫制備試劑盒采用新穎的 Normalization by Ligation(NBL)技術,消除了前期和中間樣品定量的需要,簡化了測序工作流程(圖1)。

專為節(jié)省成本且不影響質(zhì)量而構建的工作流程

FlexPrep標準化接頭包含12個內(nèi)聯(lián)條形碼,它允許超高通量和自動化友好的多重測序策略(圖2)。

Twist FlexPrep UHT文庫制備試劑盒,通過在一個試劑盒的單次測序中運行多達1152個樣本來實現(xiàn)測序通量*大化,這種提高效率的策略可以轉化為節(jié)省試劑、耗材和時間成本。與單獨處理樣本相比,F(xiàn)lexPrep?將使用的耗材減少了12倍,并將移液器吸頭的數(shù)量從標準試劑盒中使用的17,000多個減少到FlexPrep? UHT試劑盒中使用的不到4,000個。

Twist FlexPrep UHT產(chǎn)量均一,且插入片段尺寸穩(wěn)定

Twist FlexPrep UHT Library Preparation Kit支持30 ng至300 ng的起始量范圍,對全基因組測序(WGS)或靶向富集(TE)的均勻性和插入片段尺寸的影響*?。ㄈ鐖D3和圖4)。

通過靶向富集確定感興趣區(qū)域

FlexPrep的工作流程也可以擴展到靶向富集,其中單個富集反應可用于多達96個樣品。

與其他Twist文庫制備試劑盒一樣,F(xiàn)lexPrep UHT生成的高復雜性文庫在靶向富集后具有均勻的覆蓋率(表1)。結合Twsit定制Panel,以實現(xiàn)對感興趣的基因組區(qū)域的可調(diào)控且均勻的覆蓋。


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